Порядок транскрибирования текста

♦ Переписать текст, оставляя между словами пробелы в 2-3 раза больше, чем обычно, и пробел между строчками в одну строку.

♦ В пробелах между строчками, предназначенными для транскрипции, поставить знак «граница текста»: […].

♦ Прочитать текст и на строках для транскрипции расставить на конце фраз знак «продолжительная пауза»: ||.

♦ Прочитать каждую фразу и на строках для транскрипции расставить внутри фраз на конце тактов знаки «непродолжительная пауза»: |

.

♦ В стихотворных текстах на границе строфы, не совпадающей с границей такта, ставится знак «короткая пауза»: ].

♦ Прочитать каждый такт, следуя за реально произносимыми ударными слогами, и в графической записи расставить над буквами, обозначающими ударные гласные звуки, ударения:’

♦ В графической записи безударные слова присоединить к ударным с помощью знака «присоединительная скобка», например: в ̮ небе, за ̮ морем, там ̮ же.

  • Над графической записью поставить знак j, обозначающий звук [j] специальными буквами «е», «ё», «ю», «я», («и»).

Запомни! Это бывает в трех случаях:

  1. Е, Ё, Ю, Я в абсолютном начале слова: ель [jэл ’], ёж j°oш], юг [jук], яд [jam];

  2. Е, Ё, Ю, Я после гласных букв: боец [боjэц], моё [моj°о], строю [cmp°оj°y], маяк [моjак];

  3. Е, Ё, Ю, Я, И после разделительных

Ь и Ъ:

съел [cjэл], подъём [п αdj°ом], вьюга [в j°угъ], свинья [св уин jа[, соловьи[сълαвjи].

  1. позиция — а) первый предударный слог (вода)’,

б) абсолютное начало слова (апельсин)’,

в) гласные, не разделенные согласными (поэтесса).

  1. позиция — остальные безударные слоги.

I II II II I II

Например: обороноспособность.

Обозначение в транскрипции гласных фонем в разных фонетических позициях

сильная

позиция

I позиция

II позиция

!под

абс.

после

после

после

после

‘ударением!

начало

твердого

мягкого

твердого

мягкого

слова

а

а

а

иэ

Ъ

Ь

0

а

а

иэ

Ъ

Ь

э

ыэ

ыэ

иэ

Ъ

Ь

и

И

И

И

ы

ы

Ы

У

У

У

У

У

У

Образец фонетической транскрипции:

Горит восток зарёю новой. уут п°ушк’ц || дьш бαгр°овыи\

Кругами всходит к небесам

кругам’и, фсх°од’ип к ̮ н’ь6’иcaм\

Навстречу утренним лучам,

нафстр’эч’°% у утр’ьн ’им л°уч’ам\\]

Задания для самостоятельной работы

  1. Затранскрибируйте текст. Отметьте все позиционные чередования гласных и согласных фонем.

Вперёд! Без страха и сомненья

На подвиг доблестный, друзья!

Зарю святого искупленья

Уж в небесах завидел я!

Смелей! Дадим друг другу руки

И вместе двинемся вперёд,

И пусть под знаменем науки

Союз наш крепнет и растет (А. Н.Плещеев).

  1. Затранскрибируйте приведённые ниже слова. Укажите, какие фонетические процессы (законы) в области гласных здесь наблюдаются.

Старичок, жасмин, полевой, шалаш, оперативный, чернота, осенний, целиком, шерстяной, водяной, чеснок, жернова, еловый, пятаки.

  1. Чем отличаются ударные гласные в приводимых парах слов? Какая фонетическая закономерность здесь наблюдается?

Рад — ряд, гроза — грозя, шута — шутя, соло — сёла, вол — вёл, сад — сядь, лот — лёт, мат — мать, нос — нёс, мол — мёл, тук — тюк, колу — колю, лук-люк.

  1. Какие фонетические законы (явления) наблюдаются при произнесении согласных звуков в данных словах?

Над трибуной, вселиться, сгореть, с Шурой, с бантиком, вскользь, с братом, к жене, низко, без шапки, в коробку, с досады, легче, изжить.

  1. Затранскрибируйте отрывок. Отметьте случаи оглушения (редукции и ассимиляции по глухости) звонких согласных.

Вруг слышит прямо над собой

Старухи голос гробовой:

Встань, молодец: всё тихо в поле;

Ты никого не встретишь боле;

Я привела тебе коня;

Вставай, послушайся меня».

Смущённый витязь поневоле

Ползком оставил грязный ров;

Окрестность робко озирая,

Вздохнул и молвил, оживая:

Ну, слава богу, я здоров!» (А. Пушкин).

6. Затранскрибируйте данные предложения. Отметьте случаи озвончения (ассимиляции по звонкости) глухих согласных.

а) Сжатые губы Тимоши не шевелились, сдвинутые брови не расходились (И.Тургенев)

б) Волчата, все трое, крепко спали, сбившись в кучу.

в) В саду служанки, на грядах, сбирали ягоду в кустах

(А Пушкин).

г) Я, видя, что он еще млад и неразумен, отдал его под начало отцу Пимену (А.Пушкин).

д) Мне кажется, что все это отговорки для того только, чтоб ему жить здесь одному (Л.Толстой).

7. Затранскрибируйте предложения. Подчеркните все случаи и изменсния зубных в переднеязычные. Как называется это позиционное изменение согласных?

а)Между ними величаво простерлась широкогрудая река; бесшумно торжественно и неторопливо текут её воды…

б) Игнат рано утром уезжал на биржу, иногда не являлся вплоть до вечера, вечером он ездил в думу, в гости или еще куда-нибудь.

в) Посредине реки сшибаются волны двух судов, бьются борта их, и суда покачиваются.

г) Непреклонно и безжалостно было его лицо (М. Горький).

  1. Какой фонетический закон наблюдается при произнесении согласных в словах: гонщик, вагончик, мостик, бороздить, карманчик, винтик?

  2. Какой фонетический закон наблюдается при произнесении слов агентство, счастливый, праздник, невестка, голландский, альпинистский, шотландцы?

  3. Чем отличаются первые согласные звуки в словах сэр — сер, мэр — мера, нэп — нем, кэб — кепка?

  1. Докажите, что в следующих парах наблюдаются традиционные (исторические) чередования согласных звуков. Укажите варианты корней.

Река — речной, лугалужок, смехсмешить, ходить — хожу — восхождение, лететь -лечу, снег — снежный, другдружить — друзья, морозмороженое, холод — хладокомбинат — охлаждение, брызгатьбрызжу, пирогпирожок, ученикученица, рыбак — рыбачить, скука — скучать, носок — носка, лик — личный -лицо, отец — отца — отеческий, сыпать — сыплю, земля — земной, гребу — гребля, уголок — уголка, весло — вёсла, одышка — вздох — дух, круг — окружность, расписаться — роспись, топить — топлю, скука — скучать, лес — леший, любовь — люблю.

  1. На чём строится каламбур в афоризме К.Пруткова?

Приятно поласкать дитя или собаку, но всего необходимее полоскать рот.

  1. Укажите чередования звуков в корне. Какие из них являются позиционными, а какие — историческими? Укажите варианты корней.

Трава — травка, нога — ноге, рука — ручной, дневной — денёк, конец — конечный, село — сёла, пилапилят, полоскать — полощу.

  1. Затранскрибируйте отрывок из стихотворения Бориса Рыжего. Отметьте все случаи позиционных чередований звуков (гласных и согласных). Укажите исторические •и ридования в корнях слов.

Вот и кончилось лето — как тихо оно шелестело

на прощанье листвой. Потому и стою оробело

в голом сквере моём, на засыпанной снегом дорожке,

по колено в любви и тоске. Подожди хоть немножко,

хоть, немного, прошу. Я ещё не успел оглядеться

и прижаться щекой. Потому и хватаюсь за сердце,

что не видел цветов твоих синих, и жёлтых, и алых —

не срывал их в бою комарином, в руках не держал их.

15. Затранскрибируйте текст, отметьте все случаи проявления звука [j]-

Я тебя отвоюю у всех земель, у всех небес,

Оттого что лес — моя колыбель, и могила — лес,

Оттого что я на земле стою — лишь одной ногой,

Оттого что я о тебе спою — как никто другой.

Я тебя отвоюю у всех других -у той, одной,

Ты не будешь ничей жених, я — ничьей женой,

И в последнем споре возьму тебя — замолчи! —

У того, с которым Иаков стоял в ночи (М. Цветаева).

  1. Затранскрибируйте текст. Отметьте знаки, передающие щелевые согласные. Опишите их артикуляцию.

Память — это волки в поле,

Убегают, бросив взгляд,-

Как пловцы в безумном кроле,

Озираются назад! (А. Вознесенский).

  1. Затранскрибируйте текст. Отметьте все транскрипционные знаки для переднеязычных и заднеязычных согласных.

Уже было начало июля, когда князь Андрей, возвращаясь домой, въехал опять в ту берёзовую рощу, в которой этот старый корявый дуб так странно и памятно поразил его. Бубенчики ещё глуше звенели в лесу, чем полтора месяца тому назад, всё было полно, тенисто, и густо; и молодые ели, рассыпанные по лесу, не нарушали общей красоты и, подделываясь под общий характер, нежно зеленели пушистыми молодыми побегами (Л. Н.Толстой).

  1. Распределите слова по группам в зависимости от фонетических процессов, происходящих с согласными звуками (ассимиляция, редукция, диереза).

Барабанщик, молотьба, сделать, холод, лестный, мороз, стог, гигантский, верность, сказка, сгорает, агентство, честность, шов, косьба, трубопровод, безвестный, пусть, вперед, кавказский, сверстники, впустую, князь, сбросить, вести, ненастные, грусть.

  1. Укажите звуковое значение буквы «з» в словах:

Золото, груздь, зелень, изморозь, без мужа, без жены, без зятя, без шурина, без сестры, без соли.

  1. Укажите звуковое значение буквы «я» в словах:

Пять, пятак, якорь, семья, объявление, заявка, моя, трясина, янтарь.

  1. В каждой строке подчеркните слова, в которых происходит:

а) оглушение (редукция) согласного звука;

б) ассимиляция по глухости согласного звука:

  1. лук, луг, картофель, капуста, огород, подсолнух, грядка;

  2. вкусный, суп, книга, котлета, соус, кетчуп, майонез;

  3. вперёд, вниз, вверх, назад, вместе, быстро;

  4. взгляд, голос, смех, волос, глаз, ножка, пятка.

  1. Затранскрибируйте пословицы. Отметьте все позиционные чередования гласных и согласных фонем.

Грамоте учиться — всегда пригодится.

Без труда не вытащишь и рыбку из пруда.

Землю красит солнце, а человекатруд.

Ученье в счастье украшает, а при несчастье утешает.

Искусственный интеллект и транскрибирование в реальном времени | Статьи

Специалистов-транскриберов, которые могут работать в режиме реального времени, не хватает, и стоят они очень недёшево. Поэтому для многих организаций услуги преобразования речи в текст в реальном времени всё ещё недоступны. Может ли сегодняшняя технология распознавания речи помочь удовлетворить спрос на точное и доступное транскрибирование в реальном времени? Ответ «Да», и у нас есть цифры, которые это подтверждают.

Оценка способности систем с ИИ к транскрибированию в реальном времени

Ранее в этом году мы сравнили три ведущих интерфейса программирования приложений (API) для распознавания речи – Amazon Transcribe, Google Cloud Speech-to-Text и IBM Watson Speech-to-Text – с людьми-транскриберами по ряду критериев:

• Точность: скорость, с которой программа делает ошибки при расшифровке произнесённых слов, измеряется как частота ошибок в словах.
• Задержка первой гипотезы: среднее время между произнесением слова и первым выводом текста.
• Задержка стабильной гипотезы: среднее время между произнесением слова и выводом правильного текста.
• Стоимость: плата за использование соответствующей услуги.

Мы предоставили каждому API более 1500 примеров фраз из набора тестов, предоставленного компанией Texas Instruments и Массачусетским технологическим институтом. Мы сравнили результаты с эталонными расшифровками этих фраз, включёнными в набор тестов, и измерили задержку. В конце концов, мы решили не корректировать скорость транскрипции с учётом времени приёма-передачи, поскольку оно составляло относительно небольшую часть общей задержки в каждом случае.

Чтобы установить базовый уровень производительности человека-транскрибера, мы собрали и обобщили результаты из множества академических источников. Здесь под «транскрибером» мы подразумеваем специалиста, который расшифровывает речь с помощью клавиатуры компьютера, а не стенографиста, который мог бы печатать на более высокой скорости с помощью стенографа. На рынке корпоративных услуг, образования и специальных мероприятий, как правило, используют транскриберов, поскольку ставки стенографистов значительно выше.

Важно отметить, что эти результаты отражают состояние каждого API на январь 2020 года, когда проводилось тестирование. Если бы мы провели те же тесты сегодня, то производительность могла бы быть выше, поскольку технологии распознавания речи как часть машинного обучения непрерывно совершенствуется.

Результаты: сравнение транскрибирования искусственным интеллектом и человеком.

 ТочностьЗадержка
первой гипотезы
Задержка
стабильной гипотезы
Стоимость,
$ в час
Человек0.04–0.094.260–200
Amazon0.0882.9563.0341.44
Google0.0850.5760.7381.44
Google (Enhanced)0.0600.6050.7612. 16
IBM0.1041.3291.4341.20

Вывод: технология автоматического транскрибирования готова к работе в реальном времени

Каждый API обеспечивает уровень точности и задержки, вполне достаточный для работы в условиях обычных мероприятий. Задержка API Amazon была немного выше, чем у движков IBM и Google, но в целом все три сопоставимы по точности и стоимости. Мы также протестировали каждый движок на устойчивость к шуму (точность транскрибирования при наличии шума) и обнаружили, что качество аудио-оборудования, размещение микрофона и другие технические факторы имеют очень важное значение для повышения производительности.

Что все это означает на практике? Эти API-интерфейсы готовы к использованию в сценариях живых событий, но как организации могут их использовать? Для этого потребуется разработка промежуточной системы автоматического распознавания речи для захвата и потоковой передачи аудиоданных в облако; платформу цифровых подписей и систему для приёма, визуализации и отображения результата на экране; веб-портал или мобильное приложение для пользователей, сидящих далеко от мониторов или имеющих нарушения зрения; и так далее.

Другой, менее обременительный вариант – использовать готовое специальное устройство автоматического транскрибирования.

Пользуйтесь технологией автоматического транскрибирования прямо сейчас

LiveScrypt, основанный на передовой технологии распознавания речи Google, имеет профессиональные аудиовходы (XLR, TRS), поэтому вы можете записывать кристально чистый звук, что помогает искусственному интеллекту проводить транскрибирование более точно. LiveScrypt также включает в себя входы HDMI и SDI, встроенный сенсорный экран для настройки и систему QR-кода для удобной потоковой трансляции, что упрощает настройку и сокращает количество точек отказа.

Транскрипция | Определение, шаги и биология

ген

; интрон и экзон

Посмотреть все СМИ

Ключевые люди:
Дэвид Балтимор Томас Стейц Роджер Д. Корнберг
Похожие темы:
генетический код матричная РНК генетическое выражение

Просмотреть весь связанный контент →

транскрипция , синтез РНК из ДНК. Генетическая информация перетекает из ДНК в белок, вещество, которое придает организму его форму. Этот поток информации происходит посредством последовательных процессов транскрипции (от ДНК к РНК) и трансляции (от РНК к белку). Транскрипция происходит, когда есть потребность в определенном продукте гена в определенное время или в определенной ткани.

Во время транскрипции обычно копируется только одна цепь ДНК. Это называется матричной цепью, а образующиеся молекулы РНК представляют собой одноцепочечные матричные РНК (мРНК). Цепь ДНК, которая соответствует мРНК, называется кодирующей или смысловой цепью. У эукариот (организмов, обладающих ядром) исходный продукт транскрипции называется пре-мРНК. Пре-мРНК широко редактируется путем сплайсинга до того, как зрелая мРНК будет произведена и готова к трансляции рибосомой, клеточной органеллой, которая служит местом синтеза белка. Транскрипция любого гена происходит в хромосомном месте этого гена, которое является относительно коротким сегментом хромосомы. Активная транскрипция гена зависит от потребности в активности этого конкретного гена в конкретной клетке или ткани или в данный момент времени.

Подробнее Из Britannica

нуклеиновая кислота: транскрипция

Небольшие сегменты ДНК транскрибируются в РНК с помощью фермента РНК-полимеразы, который осуществляет это копирование в строго контролируемом процессе. Первым шагом является распознавание определенной последовательности ДНК, называемой промотором, которая означает начало гена. В этот момент две нити ДНК разделяются, и РНК-полимераза начинает копирование с определенной точки на одной нити ДНК, используя особый тип сахаросодержащего нуклеозида, называемого рибонуклеозид-5′-трифосфатом, чтобы начать растущую цепь. Дополнительные рибонуклеозидтрифосфаты используются в качестве субстрата, и за счет расщепления их высокоэнергетической фосфатной связи рибонуклеозидмонофосфаты включаются в растущую цепь РНК. Каждый последующий рибонуклеотид управляется комплементарными правилами спаривания оснований ДНК. Например, C (цитозин) в ДНК направляет включение G (гуанина) в РНК. Точно так же G в ДНК копируется в C в РНК, T (тимин) в A (аденин) и A в U (урацил; РНК содержит U вместо T ДНК). Синтез продолжается до тех пор, пока не будет достигнут терминирующий сигнал, после чего РНК-полимераза отпадает от ДНК и высвобождается молекула РНК.

Перед многими генами у прокариот (организмов, у которых отсутствует ядро) есть сигналы, называемые «операторами» ( см. опероны ), где специализированные белки, называемые репрессорами, связываются с ДНК непосредственно перед точкой начала транскрипции и предотвращают доступ к ДНК. ДНК с помощью РНК-полимеразы. Таким образом, эти белки-репрессоры предотвращают транскрипцию гена, физически блокируя действие РНК-полимеразы. Как правило, репрессоры освобождаются от своего блокирующего действия, когда они получают сигналы от других молекул в клетке, указывающие на необходимость экспрессии гена. Впереди некоторых прокариотических генов находятся сигналы, с которыми связываются белки-активаторы для стимуляции транскрипции.

Транскрипция у эукариот более сложная, чем у прокариот. Во-первых, РНК-полимераза высших организмов — более сложный фермент, чем относительно простой пятисубъединичный фермент прокариот. Кроме того, существует множество дополнительных факторов, которые помогают контролировать эффективность отдельных промоторов. Эти вспомогательные белки называются факторами транскрипции и обычно реагируют на сигналы внутри клетки, указывающие на необходимость транскрипции. Во многих генах человека может потребоваться несколько факторов транскрипции, прежде чем транскрипция сможет протекать эффективно. Фактор транскрипции может вызывать либо репрессию, либо активацию экспрессии генов у эукариот.

Редакторы Британской энциклопедии Эта статья была недавно пересмотрена и обновлена ​​Карой Роджерс.

Транскрипция: эпицентр экспрессии генов

J Zhejiang Univ Sci B. 2014 May; 15(5): 409–411.

doi: 10.1631/jzus.B1400113

Информация об авторе Информация об авторских правах и лицензиях Отказ от ответственности

Сложность живого организма определяется не количеством генов, а регулированием генов. Контроль над тем, какие гены экспрессировать и в какой степени, определяет последующую идентичность клеток. Транскрипция, критическая начальная стадия экспрессии генов, тонко регулируется для поддержания статуса клетки. Недавние разработки в области геномных подходов обеспечили беспрецедентный охват изучения транскрипции. Тем не менее, базовая молекулярная биология и биохимия дают механистическое представление о том, как достигается регуляция. В этой статье «Регуляция транскрипции: механизмы и биологические функции» обсуждаются последние достижения в области эпигенетики, процессинга мРНК, контроля качества РНК и трансактивации вируса иммунодефицита человека (ВИЧ).

Ген традиционно рассматривался как основная молекулярная единица наследственности (Crick, 1958; 1970). В форме ДНК или РНК он несет сырую генетическую информацию, которую можно превратить в функциональные продукты, обычно в белки. Однако количество генов не отражает сложности организма. Например, у человека около 20 000 генов, кодирующих белок, что примерно на 6000 больше, чем у дрозофилы, на 2000 больше, чем у Caenorhabditis elegans , и на 14 000 больше, чем у почкующихся дрожжей, но на ∼10 000 меньше, чем у лабораторной мушки. мышь, примерно на 5000 меньше, чем у модельного растения Arabidopsis и примерно на 17 000 меньше, чем у риса. Ясно, что уровень сложности организма достигается за счет регулирования имеющихся генов, а не просто за счет введения большего количества генов.

Центральная догма экспрессии генов включает два последовательных этапа: транскрипцию (ДНК в РНК) и трансляцию (РНК в белок). Транскрипция является ключевым этапом, который контролирует «включение и выключение» генов и впоследствии подчеркивает идентичность и статус клетки (Young, 2011; Lee and Young, 2013). Например, когда я сравниваю прядь своих волос и кончик пальца, они кажутся такими разными, как будто сделаны из разных генетических материалов. Однако дело в том, что все разные ткани и клетки моего тела содержат одну и ту же ДНК, и именно профили дифференциальной экспрессии создали функциональное разнообразие. Понимание механизма экспрессии генов поможет нам понять формирование и эволюцию жизни и найти возможные лекарства от болезней.

Мы пригласили ученых, занимающих лидирующие позиции в своих областях, поделиться своим опытом и взглядами. Ма и др. (2014) сосредоточились на механизме, открывающем и закрывающем определенные участки хроматина. Проблема начинается с упаковки ДНК человека. В растянутом состоянии общая длина ДНК человеческой клетки составляет около 3 м. В живой клетке ДНК упакована в очень компактную форму, называемую хроматином. Гены не активны, когда они находятся в уплотненной форме. Факторы, участвующие в открытии и закрытии специфических регионов, контролируют доступность генов (Guertin and Lis, 2012). Набор факторов, называемых белками поликомб-группы (PcG), участвует в модификации структуры хроматина и последующей регуляции большого количества генов. Подробно описаны динамическая природа мультисубъединичного белкового комплекса и его сложное функциональное влияние.

Генная регуляция не ограничивается поиском гена. Механизм транскрипции находит доступный промотор и собирает мультимегадальтонный белковый комплекс для инициации транскрипции (Kornberg, 2007). Как только зарождающийся транскрипт выходит из тела РНК-полимеразы II (Pol II), фермента, транскрибирующего гены, кодирующие белки, РНК защищается добавлением 5′-кэпа (Шаткин, 1976). В учебнике кепирование могло бы быть описано как единодушное явление, происходящее на каждой молекуле РНК-транскриптов. Тем не менее, Zhai and Xiang (2014) резюмируют недавнее открытие того, что неправильно кэпированная РНК подвергается контролю качества и деградации. Ранее считалось, что удаление кэпа и последующая деградация РНК происходят только после того, как РНК экспортируется в цитоплазму и инициируется трансляция. Это открытие изменило то, как кэпирование и декэпирование мРНК рассматриваются во времени и пространстве.

Деградация или обмен РНК играет важную роль в экспрессии генов (Houseley and Tollervey, 2009). По сравнению с ДНК, РНК является очень короткоживущим веществом в клетках. Его относительно быстрый оборот обеспечивает гибкость организмов, чтобы реагировать на окружающую среду и быстро адаптироваться к изменению профиля экспрессии генов. Исторически считалось, что деградация мРНК происходит только после того, как произошел хотя бы один раунд трансляции. Лю Х. и др. (2014) представили обновленный обзор многих путей деградации РНК, происходящих в ядре. Деградация зарождающихся транскриптов РНК в ядре рассматривалась как механизм контроля качества, позволяющий быстро избавиться от нежелательных РНК до того, как они будут экспортированы в цитоплазму и тратят впустую усилия рибосом на трансляцию неправильных белков.

Начало транскрипции зависит от промоторов. Сигнал терминации обычно зависит от информации о последовательности на концах генов (Richard and Manley, 2009; Guo et al., 2011). Дэвис и Ши (2014) рассматривают текущее понимание требований к последовательности и белковых факторов, участвующих в этом процессе, называемом процессингом 3′-конца мРНК. Он отрезает РНК от движущегося Pol II и добавляет к РНК участок аденина. Последовательность, управляющая этим процессом, называется сигналом полиаденилирования или сигналом полиА (Proudfoot, 19). 91). Известно, что неразборчивая природа сигнальных последовательностей полиА приводит к избирательному использованию множественных сигналов полиА (Tian and Manley, 2013). Эта особенность, описанная как альтернативное полиаденилирование, связана со многими аспектами генной экспрессии: преждевременной терминацией, сплайсингом РНК, стабильностью РНК и уровнем экспрессии (Mayr and Bartel, 2009). Однако точный механизм, который диктует использование альтернативного полиА-сигнала, неясен. В этой статье также представлена ​​простая, но широко применимая модель для описания того, как делается выбор среди множества полиА-сигналов.

Процесс образования РНК нуклеотид за нуклеотидом, удлинение транскрипции строго контролируется и переплетается со всеми вышеперечисленными событиями. В самом деле, контроль элонгации является критическим шагом в определении выхода транскрипции. Вместо того, чтобы искать открытый промотор для начала транскрипции, инициированный и приостановленный Pol II можно найти на всех экспрессируемых генах человека (Core et al. , 2012; Kwak et al., 2013). Эта приостановленная популяция Pol II служит резервом для быстрой реакции транскрипции на сигналы активации (Guo and Price, 2013). При активации положительный фактор элонгации транскрипции P-TEFb запускает быстро развивающуюся продуктивную элонгацию, которая приводит к продукции мРНК. Таким образом, P-TEFb рассматривается как ключ к быстрой амплификации экспрессии генов. Действительно, это именно тот фактор захвата вируса, который способствует их активации (Zhou et al., 2012). Лю Р. Д. и соавт. (2014) обеспечивают новейшее понимание факторов, участвующих в переходе к продуктивной элонгации, и того, как ВИЧ находит свою нишу для эффективного и смертельного репликации.

Журнал Чжэцзянского университета-НАУКА B (биомедицина и биотехнология) занимает лидирующие позиции среди рецензируемых научных журналов Китая. С момента своего основания в 2005 году редакция занимается публикацией высококачественных и влиятельных исследовательских и обзорных статей.

В этом специальном выпуске мы пригласили основных авторов недавних важных исследовательских статей, чтобы они предоставили самую актуальную информацию о своей области знаний. Исследования, которые они проводили, были новаторскими и стали важными вехами в их области. Справедливо, что все приглашенные недавно открыли свои собственные лаборатории с щедрым финансированием. Демонстрируя свою приверженность воспитанию будущих ученых, все они пригласили своих стажеров и коллег присоединиться к приключению по написанию статей. Мы считаем, что эти передовые статьи будут способствовать дискуссиям среди признанных ученых и помогут в обучении молодых исследователей.

Представляем гостевого редактора: получил степень бакалавра в Северо-восточном университете лесного хозяйства в Китае и степень магистра в Университете Бата в Соединенном Королевстве. Затем он работал с доктором Саверио БРОНА в Бирмингемском университете в Соединенном Королевстве над докторской степенью. В настоящее время он является постдокторантом в лаборатории Прайса в Университете Айовы в США. Как правило, он интересуется регуляцией экспрессии генов, и его опыт включает в себя разработку in vitro анализов транскрипции для характеристики факторов, участвующих в элонгации транскрипции Pol II.

1. Core LJ, Waterfall JJ, Gilchrist DA, et al. Определение статуса РНК-полимеразы на промоторах. Cell Rep. 2012;2(4):1025–1035. doi: 10.1016/j.celrep.2012.08.034. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

2. Crick FH. О синтезе белка. Symp Soc Exp Biol. 1958; 12: 138–163. [PubMed] [Google Scholar]

3. Крик Ф. Центральная догма молекулярной биологии. Природа. 1970;227(5258):561–563. дои: 10.1038/227561a0. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

4. Davis R, Shi Y. Код полиаденилирования: единая модель регуляции альтернативного полиаденилирования мРНК. J Zhejiang Univ-Sci B (Biomed & Biotechnol) 2014; 15 (5): 429–437. doi: 10.1631/jzus. B1400076. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

5. Guertin MJ, Lis JT. Механизмы, с помощью которых факторы транскрипции получают доступ к элементам целевой последовательности в хроматине. Curr Opin Genet Dev. 2013;23(2):116–123. doi: 10.1016/j.gde.2012.11.008. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

6. Guo J, Garrett M, Micklem G, et al. Сигналы Poly(A), расположенные вблизи 5′-конца генов, подавляются общим механизмом, предотвращающим преждевременный процессинг 3′-конца. Мол Селл Биол. 2011;31(4):639–651. doi: 10.1128/MCB.00919-10. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

7. Guo J, Price DH. Контроль элонгации транскрипции РНК-полимеразой II. Chem Rev. 2013;113(11):8583–8603. doi: 10.1021/cr400105n. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

8. Houseley J, Tollervey D. Многие пути деградации РНК. Клетка. 2009;136(4):763–776. doi: 10.1016/j.cell.2009.01.019. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

9. Корнберг Р.Д. Молекулярные основы эукариотической транскрипции. ПНАС. 2007;104(32):12955–12961. doi: 10.1073/pnas.0704138104. [Статья PMC бесплатно] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

10. Kwak H, Fuda NJ, Core LJ, et al. Точные карты РНК-полимеразы показывают, как промоторы управляют инициацией и паузой. Наука. 2013;339(6122): 950–953. doi: 10.1126/science.1229386. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

11. Lee TI, Young RA. Транскрипционная регуляция и ее неправильная регуляция при заболеваниях. Клетка. 2013;152(6):1237–1251. doi: 10.1016/j.cell.2013.02.014. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

12. Liu H, Luo M, Wen JK. Стабильность мРНК в ядре. J Zhejiang Univ-Sci B (Biomed & Biotechnol) 2014; 15 (5): 444–454. doi: 10.1631/jzus.B1400088. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

13. Liu RD, Wu J, Shao R, et al. Механизм и факторы, контролирующие транскрипцию и латентную активацию ВИЧ-1. J Zhejiang Univ-Sci B (Biomed & Biotechnol) 2014; 15 (5): 455–465. doi: 10.1631/jzus.B1400059. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

14. Ma RG, Zhang Y, Sun TT, et al. Эпигенетическая регуляция комплексами групп поликомб: внимание на роль белков CBX. J Zhejiang Univ-Sci B (Biomed & Biotechnol) 2014; 15 (5): 412–428. doi: 10.1631/jzus.B1400077. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

15. Mayr C, Bartel DP. Распространенное укорочение 3’UTR путем альтернативного расщепления и полиаденилирования активирует онкогены в раковых клетках. Клетка. 2009;138(4):673–684. doi: 10.1016/j.cell.2009.06.016. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

16. Праудфут Н. Сигналы Poly(A). Клетка. 1991;64(4):671–674. doi: 10.1016/0092-8674(91)90495-K. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

17. Ричард П., Мэнли Дж.Л. Терминация транскрипции ядерными РНК-полимеразами. Гены Дев. 2009 г.;23(11):1247–1269. doi: 10.1101/gad. 1792809. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

18. Шаткин А.Ю. Кэпирование эукариотических мРНК. Клетка. 1976; 9 (4): 645–653. doi: 10.1016/0092-8674(76)90128-8. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

19. Tian B, Manley JL. Альтернативное расщепление и полиаденилирование: длинное и короткое. Тенденции биохимических наук. 2013;38(6):312–320. doi: 10.1016/j.tibs.2013.03.005. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

20. Молодой Р.А. Контроль состояния эмбриональных стволовых клеток. Клетка. 2011;144(6):940–954. doi: 10.1016/j.cell.2011.01.032. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

21. Чжай Л.Т., Сян С. Контроль качества мРНК на 5′-конце. J Zhejiang Univ-Sci B (Biomed & Biotechnol) 2014; 15 (5): 438–443. doi: 10.1631/jzus.B1400070. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

22. Zhou Q, Li T, Price DH. Контроль элонгации РНК-полимеразой II. Анну Рев Биохим. 2012;81(1):119–143.